胶原蛋白的吸水与持水性、溶解性、乳化及乳化稳定性、起泡性等特性决定了其食品、医药和化妆品领域的应用范围。在鱼鳞胶原蛋白的提取过程中，前处理及提取方式不同也会对胶原蛋白的理化特性产生一定影响。段蕊等以鲤鱼鱼鳞为研究对象，发现采用盐酸脱钙制得的胶原蛋白具有较好的吸水性、保水性和吸油性，而用溶液脱钙制得的胶原蛋白具有较好的起泡性和凝胶性；此外，通过比较鲤鱼鳞酸溶性和酶溶性胶原蛋白的特性，发现酶溶性对热的耐受性比酸溶性低，其原因可能是胶原蛋白两端对其稳定性起着重要作用的非螺旋区域在酶的作用发牛了部分分解，从而降低了酶溶性胶原蛋白对热的耐受性。汪海波等从草鱼鱼鳞中提取酸溶性和酶溶性胶原蛋白，结果表明均为典型的型胶原并具有完整的三螺旋结构；其热变性温度分别为34.8°C、35.2°C；两种胶原样品冻千后得到的胶原海绵材料具有不同的机械性能和组织结构，酸溶性和酶溶性胶原蛋白海绵足一种多孔但拉伸承受力较弱的海绵材料。